奧姆真理教於1995年發動東京地鐵沙林毒氣恐襲，死傷慘重，釀成13死亡6, 000人受傷，《奧姆真理教與我》導演阪原淳正是其中一個受害者。

相隔廿載後的2016年，阪原淳為要尋求真相， 埋身追訪奧姆真理教的行政人員荒木浩，一同踏上回鄉到關西之火車旅程。

阪原淳與荒木浩年齡相近、背景相似，甚至同讀京都大學，但在80年代後期二人走上迥異之路: 荒木浩加入真理教，而阪原淳則選擇在東京工作。

《奧姆真理教與我》連結兩個處於對立面的人，讓他們真誠對話，帶出重建公義之信心，並為受恐襲重創後活在陰霾下的被害者解下心結。